Tid 13.15-15.00, 9/11, i Q14 (Osquldas väg 6, plan 1) presenterar följande personer:

# 0

Eget projekt, bekräfta med lärare innan du bokar.

# 1

Biokemiska nätverk, metabola nätverk och kontrollanalys. Ehlde et al 1997.

# 2

Biokemiska nätverk, synaptisk plasticitet. Bhalla et al 1999.

# 3

Biokemisk cykel av två enzymer. Guidi et al 2000.

# 4

Celldelning och cellcykelmodellering. Nowak et al 2003.

# 5

Kalciumdiffusion och buffring. Undersöker betydelsen av buffrar för diffusion av kalcium. Maeda et al 1999."

# 6

Morfogenes, axonal utväxt. Goodhill 1998.

# 7

Kemotaxis hos bakterier. Bray et al 1998.

# 8

Epigenes hos lambdaswitchen. Dynamiskasystemanalys av genetiska nätverk. Aurell 2002.

# 9

Analys av förenklade neuronmodeller. Gruber et al 2003.

# 10

Diskussion av förenklade cellmodeller. Meunier et al 2002.

# 11

Aktiva dendriter och reducerade dendritträd. Jackson et al 1997.

# 12

Small-world (skalfria) nervcellsnätverk. Nishikawa et al 2003.

# 13

Modellering av associativt minne. Gisiger et al 2000.

# 14

Aktiva dendriter. I lab3I finns frivilliga uppgifter sist i kompendiet. Prova några av dessa uppgifter. Använd filer från lab3 och programmet Genesis. I utdraget ur boken Genesis, kap 5, finns ett avsnitt om detta ämne.

# 15

Central mönstergenerator. Tutorialen CPG i Genesispaketet beskriver ett litet nätverk som har oscillatorisk aktivitet. Modellen finns även beskriven i kap 8 i Genesisboken. Se /info/biomod04/projekt/genesis/Scripts/CPG/. Prova att ändra konnektiviteten eller inputen.

# 16

Kortikala neurala nätverk. Tutorial 7 i Genesispaketet är en modell av en liten kortikal area med mexican hat konnektivitet. Se /info/biomod04/projekt/genesis/Scripts/tutorial7/. Prova att ändra konnektiviteten eller inputmönstret.

# 17

Effekten av synaptisk input på aktiva dendriter. Hanson et al 2004.

# 18

Konsekvenser av 'gap junctions' i inhibitoriskt nervcellsnätverk. DiGarbo et al 2005.

# 19 1, Johan Nyqvist och Caroline Omre

Matematisk modellering av 'gap junctions'. Vogel et al 2002.

# 20

Modellering av en DNA sekvenseringsmetod - Pyrosequencing. Svantesson et al 2003.

# 21

Modellering av muskelaktivering under t.ex. gångrörelser. Ekeberg et al 2005.

# 22

Detaljerad neuronmodell av en viktig celltyp i striatum (dvs inputsteget i basala ganglierna). Wolf et al 2005.

Tid 15.15-17.00, 9/11, i Q14 (Osquldas väg 6, plan 1) presenterar följande personer:

# 0

Eget projekt, bekräfta med lärare innan du bokar.

# 1

Biokemiska nätverk, metabola nätverk och kontrollanalys. Ehlde et al 1997.

# 2

Biokemiska nätverk, synaptisk plasticitet. Bhalla et al 1999.

# 3

Biokemisk cykel av två enzymer. Guidi et al 2000.

# 4

Celldelning och cellcykelmodellering. Nowak et al 2003.

# 5

Kalciumdiffusion och buffring. Undersöker betydelsen av buffrar för diffusion av kalcium. Maeda et al 1999."

# 6

Morfogenes, axonal utväxt. Goodhill 1998.

# 7

Kemotaxis hos bakterier. Bray et al 1998.

# 8

Epigenes hos lambdaswitchen. Dynamiskasystemanalys av genetiska nätverk. Aurell 2002.

# 9

Analys av förenklade neuronmodeller. Gruber et al 2003.

# 10

Diskussion av förenklade cellmodeller. Meunier et al 2002.

# 11

Aktiva dendriter och reducerade dendritträd. Jackson et al 1997.

# 12

Small-world (skalfria) nervcellsnätverk. Nishikawa et al 2003.

# 13

Modellering av associativt minne. Gisiger et al 2000.

# 14

Aktiva dendriter. I lab3I finns frivilliga uppgifter sist i kompendiet. Prova några av dessa uppgifter. Använd filer från lab3 och programmet Genesis. I utdraget ur boken Genesis, kap 5, finns ett avsnitt om detta ämne.

# 15

Central mönstergenerator. Tutorialen CPG i Genesispaketet beskriver ett litet nätverk som har oscillatorisk aktivitet. Modellen finns även beskriven i kap 8 i Genesisboken. Se /info/biomod04/projekt/genesis/Scripts/CPG/. Prova att ändra konnektiviteten eller inputen.

# 16

Kortikala neurala nätverk. Tutorial 7 i Genesispaketet är en modell av en liten kortikal area med mexican hat konnektivitet. Se /info/biomod04/projekt/genesis/Scripts/tutorial7/. Prova att ändra konnektiviteten eller inputmönstret.

# 17

Effekten av synaptisk input på aktiva dendriter. Hanson et al 2004.

# 18

Konsekvenser av 'gap junctions' i inhibitoriskt nervcellsnätverk. DiGarbo et al 2005.

# 19

Matematisk modellering av 'gap junctions'. Vogel et al 2002.

# 20

Modellering av en DNA sekvenseringsmetod - Pyrosequencing. Svantesson et al 2003.

# 21

Modellering av muskelaktivering under t.ex. gångrörelser. Ekeberg et al 2005.

# 22

Detaljerad neuronmodell av en viktig celltyp i striatum (dvs inputsteget i basala ganglierna). Wolf et al 2005.